Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC10A4Q96EP9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC10A4Q96EP9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC10A4Q96EP9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC10A4Q96EP9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC10A4Q96EP9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC10A4Q96EP9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC10A4Q96EP9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC10A4Q96EP9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC10A4Q96EP9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC10A4Q96EP9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC10A4Q96EP9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms