Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRPL53Q96EL3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms