Protein–RNA interactions for Protein: Q96E14

RMI2, RecQ-mediated genome instability protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMI2Q96E14 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RMI2Q96E14 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RMI2Q96E14 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RMI2Q96E14 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RMI2Q96E14 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RMI2Q96E14 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RMI2Q96E14 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RMI2Q96E14 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RMI2Q96E14 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RMI2Q96E14 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RMI2Q96E14 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RMI2Q96E14 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RMI2Q96E14 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RMI2Q96E14 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RMI2Q96E14 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RMI2Q96E14 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RMI2Q96E14 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RMI2Q96E14 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RMI2Q96E14 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RMI2Q96E14 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RMI2Q96E14 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RMI2Q96E14 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RMI2Q96E14 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RMI2Q96E14 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RMI2Q96E14 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RMI2Q96E14 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RMI2Q96E14 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RMI2Q96E14 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RMI2Q96E14 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RMI2Q96E14 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RMI2Q96E14 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms