Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTHRC1Q96CG8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTHRC1Q96CG8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTHRC1Q96CG8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTHRC1Q96CG8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms