Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHMP4CQ96CF2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHMP4CQ96CF2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms