Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDF1Q96CC6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHBDF1Q96CC6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms