Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDCCAG3Q96C92 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDCCAG3Q96C92 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms