Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE4

FUBP1, Far upstream element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1Q96AE4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FUBP1Q96AE4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FUBP1Q96AE4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms