Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NXPE3Q969Y0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NXPE3Q969Y0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms