Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX4Q969G2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX4Q969G2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms