Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HPS3Q969F9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS3Q969F9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
HPS3Q969F9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms