Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXT2Q93063 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXT2Q93063 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXT2Q93063 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXT2Q93063 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXT2Q93063 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXT2Q93063 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXT2Q93063 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXT2Q93063 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXT2Q93063 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXT2Q93063 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXT2Q93063 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXT2Q93063 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXT2Q93063 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXT2Q93063 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXT2Q93063 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EXT2Q93063 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXT2Q93063 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EXT2Q93063 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXT2Q93063 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms