Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A6Q92581 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms