Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX19Q92543 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX19Q92543 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1149 ms