Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM3CQ92520 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM3CQ92520 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM3CQ92520 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM3CQ92520 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM3CQ92520 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM3CQ92520 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM3CQ92520 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM3CQ92520 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM3CQ92520 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM3CQ92520 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM3CQ92520 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM3CQ92520 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM3CQ92520 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM3CQ92520 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM3CQ92520 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM3CQ92520 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM3CQ92520 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM3CQ92520 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM3CQ92520 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM3CQ92520 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM3CQ92520 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM3CQ92520 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM3CQ92520 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM3CQ92520 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM3CQ92520 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM3CQ92520 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM3CQ92520 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM3CQ92520 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM3CQ92520 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms