Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DCAF4Q8WV16 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DCAF4Q8WV16 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DCAF4Q8WV16 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms