Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GIPC3Q8TF64 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIPC3Q8TF64 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIPC3Q8TF64 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms