Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHBDD1Q8TEB9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDD1Q8TEB9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms