Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD5Q8TDI0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHD5Q8TDI0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHD5Q8TDI0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD5Q8TDI0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms