Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLHC1Q8NHS4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLHC1Q8NHS4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms