Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KNL1Q8NG31 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms