Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP35Q8NFH5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms