Protein–RNA interactions for Protein: Q8NET8

TRPV3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV3Q8NET8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPV3Q8NET8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRPV3Q8NET8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPV3Q8NET8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPV3Q8NET8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPV3Q8NET8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPV3Q8NET8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPV3Q8NET8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPV3Q8NET8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPV3Q8NET8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPV3Q8NET8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPV3Q8NET8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPV3Q8NET8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPV3Q8NET8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms