Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC9Q8NEP7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC9Q8NEP7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHDC9Q8NEP7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms