Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG4

FAM83F, Protein FAM83F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83FQ8NEG4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM83FQ8NEG4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM83FQ8NEG4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms