Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDPRQ8NCN5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDPRQ8NCN5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms