Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SUMF1Q8NBK3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUMF1Q8NBK3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUMF1Q8NBK3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SUMF1Q8NBK3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUMF1Q8NBK3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUMF1Q8NBK3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUMF1Q8NBK3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUMF1Q8NBK3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUMF1Q8NBK3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SUMF1Q8NBK3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms