Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KBTBD3Q8NAB2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KBTBD3Q8NAB2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KBTBD3Q8NAB2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KBTBD3Q8NAB2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KBTBD3Q8NAB2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
KBTBD3Q8NAB2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KBTBD3Q8NAB2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KBTBD3Q8NAB2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms