Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAAF3Q8N9W5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DNAAF3Q8N9W5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAAF3Q8N9W5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms