Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J2

MINDY1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY1Q8N5J2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MINDY1Q8N5J2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MINDY1Q8N5J2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MINDY1Q8N5J2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MINDY1Q8N5J2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MINDY1Q8N5J2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MINDY1Q8N5J2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MINDY1Q8N5J2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MINDY1Q8N5J2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MINDY1Q8N5J2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MINDY1Q8N5J2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MINDY1Q8N5J2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MINDY1Q8N5J2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MINDY1Q8N5J2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MINDY1Q8N5J2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MINDY1Q8N5J2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MINDY1Q8N5J2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MINDY1Q8N5J2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MINDY1Q8N5J2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MINDY1Q8N5J2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MINDY1Q8N5J2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms