Protein–RNA interactions for Protein: Q8N468

MFSD4A, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD4AQ8N468 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MFSD4AQ8N468 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MFSD4AQ8N468 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD4AQ8N468 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD4AQ8N468 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD4AQ8N468 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD4AQ8N468 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD4AQ8N468 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD4AQ8N468 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD4AQ8N468 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD4AQ8N468 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD4AQ8N468 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD4AQ8N468 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms