Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2U9

PQLC1, PQ-loop repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC1Q8N2U9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PQLC1Q8N2U9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PQLC1Q8N2U9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PQLC1Q8N2U9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms