Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z3

SPICE1, Spindle and centriole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1Q8N0Z3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SPICE1Q8N0Z3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPICE1Q8N0Z3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPICE1Q8N0Z3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms