Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D3Q8IZS8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D3Q8IZS8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms