Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSIG1Q86XK7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms