Protein–RNA interactions for Protein: Q86XF0

DHFR2, Dihydrofolate reductase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHFR2Q86XF0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DHFR2Q86XF0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHFR2Q86XF0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHFR2Q86XF0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHFR2Q86XF0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHFR2Q86XF0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHFR2Q86XF0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHFR2Q86XF0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHFR2Q86XF0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms