Protein–RNA interactions for Protein: Q86UV7

TRIM73, Tripartite motif-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM73Q86UV7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms