Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01551Q86U37 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms