Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2X4

PID1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PID1Q7Z2X4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PID1Q7Z2X4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PID1Q7Z2X4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PID1Q7Z2X4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PID1Q7Z2X4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms