Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
FGD6Q6ZV73 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
FGD6Q6ZV73 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
FGD6Q6ZV73 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
FGD6Q6ZV73 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
FGD6Q6ZV73 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
FGD6Q6ZV73 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
FGD6Q6ZV73 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
FGD6Q6ZV73 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
FGD6Q6ZV73 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
FGD6Q6ZV73 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
FGD6Q6ZV73 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
FGD6Q6ZV73 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
FGD6Q6ZV73 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
FGD6Q6ZV73 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
FGD6Q6ZV73 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
FGD6Q6ZV73 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
FGD6Q6ZV73 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
FGD6Q6ZV73 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
FGD6Q6ZV73 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
FGD6Q6ZV73 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms