Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
LRRC9Q6ZRR7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
LRRC9Q6ZRR7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
LRRC9Q6ZRR7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
LRRC9Q6ZRR7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms