Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms