Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF493Q6ZR52 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF493Q6ZR52 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF493Q6ZR52 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms