Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN01

MAMSTR, MEF2-activating motif and SAP domain-containing transcriptional regulator, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAMSTRQ6ZN01 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAMSTRQ6ZN01 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAMSTRQ6ZN01 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAMSTRQ6ZN01 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAMSTRQ6ZN01 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAMSTRQ6ZN01 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAMSTRQ6ZN01 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAMSTRQ6ZN01 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms