Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VSTM1Q6UX27 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VSTM1Q6UX27 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VSTM1Q6UX27 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms