Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms