Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL17Q6TDP4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL17Q6TDP4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL17Q6TDP4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms