Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL35Q6PF15 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms