Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC4Q6P4E1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASC4Q6P4E1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASC4Q6P4E1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms