Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCSAPQ6IQ19 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCSAPQ6IQ19 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCSAPQ6IQ19 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCSAPQ6IQ19 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCSAPQ6IQ19 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCSAPQ6IQ19 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCSAPQ6IQ19 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCSAPQ6IQ19 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCSAPQ6IQ19 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCSAPQ6IQ19 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCSAPQ6IQ19 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCSAPQ6IQ19 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCSAPQ6IQ19 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCSAPQ6IQ19 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
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